Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COPS7AQ9UBW8 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COPS7AQ9UBW8 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
COPS7AQ9UBW8 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
COPS7AQ9UBW8 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COPS7AQ9UBW8 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COPS7AQ9UBW8 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COPS7AQ9UBW8 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COPS7AQ9UBW8 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COPS7AQ9UBW8 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COPS7AQ9UBW8 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COPS7AQ9UBW8 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COPS7AQ9UBW8 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COPS7AQ9UBW8 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
COPS7AQ9UBW8 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COPS7AQ9UBW8 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COPS7AQ9UBW8 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
COPS7AQ9UBW8 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COPS7AQ9UBW8 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COPS7AQ9UBW8 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COPS7AQ9UBW8 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COPS7AQ9UBW8 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COPS7AQ9UBW8 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COPS7AQ9UBW8 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COPS7AQ9UBW8 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
COPS7AQ9UBW8 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
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