Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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LHX9Q9NQ69 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
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LHX9Q9NQ69 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
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LHX9Q9NQ69 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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LHX9Q9NQ69 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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LHX9Q9NQ69 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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LHX9Q9NQ69 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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LHX9Q9NQ69 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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