Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRAPPC9Q96Q05 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRAPPC9Q96Q05 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms