Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE3

SEH1L, Nucleoporin SEH1, humanhuman

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1LQ96EE3 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEH1LQ96EE3 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SEH1LQ96EE3 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SEH1LQ96EE3 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SEH1LQ96EE3 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SEH1LQ96EE3 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SEH1LQ96EE3 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SEH1LQ96EE3 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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