Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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