Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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