Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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