Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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GEN1Q17RS7 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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GEN1Q17RS7 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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GEN1Q17RS7 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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GEN1Q17RS7 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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GEN1Q17RS7 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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GEN1Q17RS7 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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GEN1Q17RS7 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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GEN1Q17RS7 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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GEN1Q17RS7 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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