Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SYPL1Q16563 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYPL1Q16563 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms