Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC0.6□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
TNXAQ16473 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TNXAQ16473 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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