Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC-0.32□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.34□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
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