Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC85BQ15834 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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