Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SS18Q15532 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SS18Q15532 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SS18Q15532 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SS18Q15532 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SS18Q15532 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SS18Q15532 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SS18Q15532 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SS18Q15532 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SS18Q15532 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SS18Q15532 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SS18Q15532 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SS18Q15532 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SS18Q15532 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SS18Q15532 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SS18Q15532 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SS18Q15532 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SS18Q15532 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SS18Q15532 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms