Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
SEC23BQ15437 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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