Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHD4Q14839 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms