Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
APOFQ13790 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
APOFQ13790 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
APOFQ13790 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
APOFQ13790 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
APOFQ13790 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
APOFQ13790 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
APOFQ13790 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
APOFQ13790 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
APOFQ13790 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
APOFQ13790 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
APOFQ13790 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
APOFQ13790 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
APOFQ13790 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
APOFQ13790 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
APOFQ13790 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
APOFQ13790 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
APOFQ13790 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.51□□□□□ -2.33
APOFQ13790 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
APOFQ13790 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
APOFQ13790 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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APOFQ13790 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
APOFQ13790 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
APOFQ13790 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
APOFQ13790 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
APOFQ13790 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
APOFQ13790 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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APOFQ13790 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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APOFQ13790 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
APOFQ13790 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
APOFQ13790 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
APOFQ13790 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
APOFQ13790 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.49□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
APOFQ13790 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
APOFQ13790 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
APOFQ13790 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
APOFQ13790 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
APOFQ13790 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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