Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEUROD1Q13562 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
NEUROD1Q13562 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms