Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TUBB3Q13509 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
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TUBB3Q13509 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUBB3Q13509 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUBB3Q13509 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUBB3Q13509 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUBB3Q13509 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
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TUBB3Q13509 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUBB3Q13509 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUBB3Q13509 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
TUBB3Q13509 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
TUBB3Q13509 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
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TUBB3Q13509 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUBB3Q13509 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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TUBB3Q13509 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUBB3Q13509 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUBB3Q13509 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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TUBB3Q13509 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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TUBB3Q13509 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TUBB3Q13509 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TUBB3Q13509 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TUBB3Q13509 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TUBB3Q13509 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
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TUBB3Q13509 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUBB3Q13509 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUBB3Q13509 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUBB3Q13509 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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TUBB3Q13509 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUBB3Q13509 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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TUBB3Q13509 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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TUBB3Q13509 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
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TUBB3Q13509 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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TUBB3Q13509 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
TUBB3Q13509 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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TUBB3Q13509 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
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TUBB3Q13509 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBB3Q13509 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBB3Q13509 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBB3Q13509 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBB3Q13509 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBB3Q13509 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBB3Q13509 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBB3Q13509 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TUBB3Q13509 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBB3Q13509 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
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TUBB3Q13509 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBB3Q13509 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBB3Q13509 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TUBB3Q13509 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBB3Q13509 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBB3Q13509 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TUBB3Q13509 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TUBB3Q13509 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TUBB3Q13509 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBB3Q13509 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBB3Q13509 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUBB3Q13509 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TUBB3Q13509 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TUBB3Q13509 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TUBB3Q13509 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TUBB3Q13509 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBB3Q13509 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBB3Q13509 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBB3Q13509 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBB3Q13509 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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