Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TCIRG1Q13488 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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