Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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FOXE3Q13461 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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FOXE3Q13461 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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FOXE3Q13461 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
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FOXE3Q13461 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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FOXE3Q13461 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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FOXE3Q13461 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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FOXE3Q13461 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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FOXE3Q13461 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXE3Q13461 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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