Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.38□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.37□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
XRCC4Q13426 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms