Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
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ITGB3BPQ13352 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
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ITGB3BPQ13352 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
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ITGB3BPQ13352 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ITGB3BPQ13352 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
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ITGB3BPQ13352 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
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ITGB3BPQ13352 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
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ITGB3BPQ13352 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ITGB3BPQ13352 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
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