Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.92□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ECH1Q13011 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ECH1Q13011 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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