Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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GTF3C1Q12789 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
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GTF3C1Q12789 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
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GTF3C1Q12789 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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GTF3C1Q12789 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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GTF3C1Q12789 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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GTF3C1Q12789 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
GTF3C1Q12789 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
GTF3C1Q12789 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
GTF3C1Q12789 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
GTF3C1Q12789 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
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