Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
FOXO1Q12778 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXO1Q12778 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 321.9 ms