Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC-0.77□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CPSF1Q10570 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.5 ms