Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC-1.41□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-1.46□□□□□ -2.64
CENPEQ02224 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC-1.46□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms