Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CENPFP49454 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CENPFP49454 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC-1.87□□□□□ -2.71
CENPFP49454 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CENPFP49454 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CENPFP49454 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CENPFP49454 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CENPFP49454 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CENPFP49454 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CENPFP49454 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CENPFP49454 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CENPFP49454 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CENPFP49454 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CENPFP49454 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CENPFP49454 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CENPFP49454 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CENPFP49454 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CENPFP49454 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC-1.88□□□□□ -2.71
CENPFP49454 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CENPFP49454 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CENPFP49454 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CENPFP49454 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPFP49454 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPFP49454 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPFP49454 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPFP49454 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPFP49454 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPFP49454 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPFP49454 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPFP49454 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPFP49454 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPFP49454 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPFP49454 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPFP49454 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPFP49454 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CENPFP49454 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPFP49454 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPFP49454 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPFP49454 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPFP49454 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPFP49454 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPFP49454 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPFP49454 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPFP49454 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPFP49454 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPFP49454 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPFP49454 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPFP49454 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPFP49454 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPFP49454 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CENPFP49454 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
CENPFP49454 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
CENPFP49454 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
CENPFP49454 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
CENPFP49454 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
CENPFP49454 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
CENPFP49454 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-1.91□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC-1.91□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC-1.91□□□□□ -2.72
CENPFP49454 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPFP49454 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPFP49454 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPFP49454 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPFP49454 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPFP49454 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CENPFP49454 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CENPFP49454 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CENPFP49454 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CENPFP49454 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CENPFP49454 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CENPFP49454 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CENPFP49454 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC-1.93□□□□□ -2.72
CENPFP49454 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-1.93□□□□□ -2.72
CENPFP49454 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CENPFP49454 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-1.93□□□□□ -2.72
CENPFP49454 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CENPFP49454 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CENPFP49454 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CENPFP49454 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC-1.94□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC-1.94□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CENPFP49454 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CENPFP49454 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC-1.94□□□□□ -2.72
CENPFP49454 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CENPFP49454 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CENPFP49454 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CENPFP49454 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms