Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
SCN8AQ9UQD0 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.41
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
SCN8AQ9UQD0 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
SCN8AQ9UQD0 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.41
SCN8AQ9UQD0 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
SCN8AQ9UQD0 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
SCN8AQ9UQD0 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
SCN8AQ9UQD0 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.41
SCN8AQ9UQD0 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.41
SCN8AQ9UQD0 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
SCN8AQ9UQD0 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
SCN8AQ9UQD0 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
SCN8AQ9UQD0 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
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SCN8AQ9UQD0 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCN8AQ9UQD0 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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SCN8AQ9UQD0 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
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SCN8AQ9UQD0 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCN8AQ9UQD0 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCN8AQ9UQD0 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCN8AQ9UQD0 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCN8AQ9UQD0 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCN8AQ9UQD0 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCN8AQ9UQD0 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCN8AQ9UQD0 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCN8AQ9UQD0 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCN8AQ9UQD0 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCN8AQ9UQD0 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCN8AQ9UQD0 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCN8AQ9UQD0 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCN8AQ9UQD0 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCN8AQ9UQD0 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
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