Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP25Q9UHP3 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
USP25Q9UHP3 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP25Q9UHP3 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP25Q9UHP3 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP25Q9UHP3 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP25Q9UHP3 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP25Q9UHP3 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP25Q9UHP3 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP25Q9UHP3 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP25Q9UHP3 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP25Q9UHP3 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP25Q9UHP3 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP25Q9UHP3 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP25Q9UHP3 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP25Q9UHP3 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP25Q9UHP3 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP25Q9UHP3 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP25Q9UHP3 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP25Q9UHP3 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
USP25Q9UHP3 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
USP25Q9UHP3 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP25Q9UHP3 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP25Q9UHP3 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP25Q9UHP3 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP25Q9UHP3 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP25Q9UHP3 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP25Q9UHP3 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USP25Q9UHP3 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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