Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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