Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC0.86□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
C9orf135Q5VTT2 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC0.83□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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