Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q1T7F1 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q1T7F1 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC0.22□□□□□ -2.37
Q1T7F1 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q1T7F1 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q1T7F1 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q1T7F1 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q1T7F1 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q1T7F1 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q1T7F1 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q1T7F1 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q1T7F1 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
Q1T7F1 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q1T7F1 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q1T7F1 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q1T7F1 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q1T7F1 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q1T7F1 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q1T7F1 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q1T7F1 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
Q1T7F1 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q1T7F1 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q1T7F1 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q1T7F1 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q1T7F1 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Q1T7F1 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
Q1T7F1 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Q1T7F1 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Q1T7F1 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Q1T7F1 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Q1T7F1 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Q1T7F1 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Q1T7F1 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Q1T7F1 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Q1T7F1 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Q1T7F1 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
Q1T7F1 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Q1T7F1 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Q1T7F1 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Q1T7F1 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Q1T7F1 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Q1T7F1 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Q1T7F1 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Q1T7F1 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
Q1T7F1 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Q1T7F1 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
Q1T7F1 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Q1T7F1 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Q1T7F1 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Q1T7F1 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
Q1T7F1 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Q1T7F1 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Q1T7F1 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Q1T7F1 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Q1T7F1 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Q1T7F1 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Q1T7F1 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Q1T7F1 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Q1T7F1 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Q1T7F1 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Q1T7F1 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms