Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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GEN1Q17RS7 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GEN1Q17RS7 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GEN1Q17RS7 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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