Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CA9Q16790 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CA9Q16790 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CA9Q16790 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CA9Q16790 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CA9Q16790 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CA9Q16790 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CA9Q16790 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CA9Q16790 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CA9Q16790 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CA9Q16790 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
CA9Q16790 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CA9Q16790 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CA9Q16790 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CA9Q16790 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CA9Q16790 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CA9Q16790 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CA9Q16790 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CA9Q16790 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CA9Q16790 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CA9Q16790 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CA9Q16790 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CA9Q16790 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CA9Q16790 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CA9Q16790 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CA9Q16790 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CA9Q16790 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CA9Q16790 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CA9Q16790 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CA9Q16790 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
CA9Q16790 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
CA9Q16790 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CA9Q16790 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CA9Q16790 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CA9Q16790 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CA9Q16790 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CA9Q16790 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CA9Q16790 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CA9Q16790 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CA9Q16790 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CA9Q16790 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CA9Q16790 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CA9Q16790 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CA9Q16790 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CA9Q16790 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CA9Q16790 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CA9Q16790 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CA9Q16790 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CA9Q16790 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CA9Q16790 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CA9Q16790 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CA9Q16790 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CA9Q16790 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CA9Q16790 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CA9Q16790 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CA9Q16790 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CA9Q16790 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CA9Q16790 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CA9Q16790 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CA9Q16790 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CA9Q16790 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CA9Q16790 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CA9Q16790 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CA9Q16790 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CA9Q16790 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CA9Q16790 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CA9Q16790 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CA9Q16790 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CA9Q16790 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CA9Q16790 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CA9Q16790 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CA9Q16790 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CA9Q16790 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CA9Q16790 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CA9Q16790 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CA9Q16790 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CA9Q16790 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CA9Q16790 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CA9Q16790 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CA9Q16790 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CA9Q16790 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CA9Q16790 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CA9Q16790 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CA9Q16790 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CA9Q16790 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CA9Q16790 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CA9Q16790 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CA9Q16790 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CA9Q16790 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CA9Q16790 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CA9Q16790 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CA9Q16790 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CA9Q16790 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CA9Q16790 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CA9Q16790 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CA9Q16790 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CA9Q16790 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CA9Q16790 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CA9Q16790 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CA9Q16790 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.4 ms