Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
FXNQ16595 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FXNQ16595 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FXNQ16595 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FXNQ16595 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FXNQ16595 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FXNQ16595 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FXNQ16595 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FXNQ16595 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
FXNQ16595 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
FXNQ16595 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FXNQ16595 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FXNQ16595 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FXNQ16595 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
FXNQ16595 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FXNQ16595 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FXNQ16595 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FXNQ16595 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
FXNQ16595 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
FXNQ16595 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FXNQ16595 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FXNQ16595 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FXNQ16595 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FXNQ16595 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
FXNQ16595 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FXNQ16595 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FXNQ16595 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FXNQ16595 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
FXNQ16595 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FXNQ16595 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
FXNQ16595 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
FXNQ16595 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FXNQ16595 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
FXNQ16595 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FXNQ16595 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FXNQ16595 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FXNQ16595 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FXNQ16595 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FXNQ16595 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FXNQ16595 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FXNQ16595 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FXNQ16595 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FXNQ16595 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FXNQ16595 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FXNQ16595 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FXNQ16595 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FXNQ16595 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FXNQ16595 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FXNQ16595 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FXNQ16595 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FXNQ16595 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3□□□□□ -1.93
FXNQ16595 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
FXNQ16595 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
FXNQ16595 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
FXNQ16595 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FXNQ16595 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FXNQ16595 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FXNQ16595 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FXNQ16595 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FXNQ16595 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FXNQ16595 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FXNQ16595 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FXNQ16595 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FXNQ16595 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
FXNQ16595 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FXNQ16595 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FXNQ16595 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FXNQ16595 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FXNQ16595 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FXNQ16595 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FXNQ16595 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FXNQ16595 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FXNQ16595 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FXNQ16595 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FXNQ16595 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FXNQ16595 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FXNQ16595 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FXNQ16595 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FXNQ16595 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
FXNQ16595 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FXNQ16595 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FXNQ16595 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FXNQ16595 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FXNQ16595 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FXNQ16595 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FXNQ16595 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FXNQ16595 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FXNQ16595 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FXNQ16595 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
FXNQ16595 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FXNQ16595 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FXNQ16595 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FXNQ16595 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FXNQ16595 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FXNQ16595 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FXNQ16595 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FXNQ16595 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FXNQ16595 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FXNQ16595 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
FXNQ16595 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.7 ms