Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SCN9AQ15858 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SCN9AQ15858 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
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