Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.08□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HMGN3Q15651 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
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