Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNHIT3Q15649 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZNHIT3Q15649 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms