Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SS18Q15532 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SS18Q15532 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SS18Q15532 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SS18Q15532 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
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