Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBE3CQ15386 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms