Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERC3Q15034 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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