Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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