Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SMAD4Q13485 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
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