Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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