Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
XRCC4Q13426 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC0.43□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
XRCC4Q13426 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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