Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATMQ13315 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATMQ13315 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATMQ13315 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATMQ13315 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATMQ13315 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATMQ13315 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
ATMQ13315 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATMQ13315 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATMQ13315 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATMQ13315 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATMQ13315 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATMQ13315 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATMQ13315 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATMQ13315 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATMQ13315 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATMQ13315 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATMQ13315 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATMQ13315 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATMQ13315 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ATMQ13315 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATMQ13315 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATMQ13315 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATMQ13315 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATMQ13315 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATMQ13315 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATMQ13315 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATMQ13315 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATMQ13315 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATMQ13315 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATMQ13315 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATMQ13315 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATMQ13315 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATMQ13315 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATMQ13315 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATMQ13315 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATMQ13315 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATMQ13315 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ATMQ13315 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ATMQ13315 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
ATMQ13315 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ATMQ13315 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
ATMQ13315 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ATMQ13315 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ATMQ13315 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ATMQ13315 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
ATMQ13315 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ATMQ13315 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ATMQ13315 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATMQ13315 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATMQ13315 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATMQ13315 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATMQ13315 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATMQ13315 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATMQ13315 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATMQ13315 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATMQ13315 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATMQ13315 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATMQ13315 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATMQ13315 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATMQ13315 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ATMQ13315 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ATMQ13315 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ATMQ13315 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
ATMQ13315 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ATMQ13315 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
ATMQ13315 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
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