Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CLN3Q13286 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms