Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
CBX3Q13185 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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