Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHAF1BQ13112 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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